- Керівництво
- Головний спеціаліст з питань запобігання корупції
- Головний спеціаліст з режимно-секретної роботи
- Головний спеціаліст із зв’язків з громадськістю
- Відділ організації реєстраційної діяльності та допуску водіїв до керування транспортними засобами
- Відділ логістики
- Сектор фінансового забезпечення та бухгалтерського обліку
- Сектор персоналу
- Сектор юридичного забезпечення
- Сектор організації діяльності та планування
- Сектор документального забезпечення
- Сектор взаємодії із суб’єктами обов’язкового технічного контролю
- Сектор організації допущення транспортних засобів до перевезення небезпечних вантажів та підвищення кваліфікації водіїв
- Сектор інформатизації та довідкового забезпечення
- Територіальний сервісний центр № 4841 (на правах відділу, м. Миколаїв)
- Територіальний сервісний центр № 4842 (на правах відділу, м. Первомайськ)
- Територіальний сервісний центр № 4843 (на правах відділу, м. Нова Одеса)
- Територіальний сервісний центр № 4844 (на правах відділу, м. Вознесенськ)
- Територіальний сервісний центр № 1845 (на правах відділу, м. Новий Буг)